医生收回扣的立案标准主要依据《中华人民共和国刑法》第一百六十三条的规定，具体金额标准如下：
数额较大：
个人索取或非法取得他人财物，金额累积达六万元人民币以上者，即会被判定为“数额较大”，启动立案追诉程序。
数额巨大：
金额达到六万元人民币或以上的，将被视为标准的“数额巨大”，符合立案追诉的条件。
其他较重情节：
数额在3万元以上不满20万元的，属于“数额较大”，若具有其他较重情节，如多次索贿、为他人牟取不正当利益致使公共财产、国家和人民利益遭受损失、为他人谋取职务提拔或调整等，也应予立案。
综上所述，医生收回扣的立案标准主要取决于受贿金额的大小及其他相关情节。一般来说，受贿金额达到六万元人民币即可被视为数额较大，而三万元及以上则可能构成数额较大或其他较重情节，从而启动立案追诉程序。
建议医疗机构和相关部门加强监管，对医生收受回扣的行为进行严厉打击，维护医疗行业的正常秩序和患者的合法权益。
