当您在银行柜台存钱后发现金额少了，可以采取以下步骤处理：
持身份证和银行卡到银行柜台询问，要求银行对ATM进行查账，以实际存入的数额为准。
查看监控录像，确认存钱的整个过程，特别是您交给银行工作人员之前是否自己又点了一遍钱。
从钱的来源和存钱的过程中寻找证据，例如通过银行流水、消费支出记录等方式来佐证您实际存入的金额。
如果工作人员尚未清机，可以留下电话号码等待清出时通知，银行一般不会退还现金，而是将钱打到您操作的卡上。
如果怀疑是银行工作人员失误导致的存款少记，可以向银行提出申诉，并要求查看相关凭据。在第三方监督下进行申诉可以增加申诉成功的可能性。
如果问题无法通过银行内部解决，您可以向相关监管机构投诉，例如银保监会。
在必要情况下，可以寻求法律帮助，例如向人民法院提起刑事自诉，但需要有充分的证据证明银行存在过错。
建议您尽快联系银行，并提供详细的存款记录和证据，以便银行能够迅速核实并解决问题。
