化学物质、 原子和 离子都包含元素。化学物质：根据文档内容，任何物质都是由元素组成的，无论是天然存在的还是人工合成的。元素是构成化学物质的基本单元，其性质由最外层电子数决定，而元素的种类则由质子数决定。原子：原子是元素的基本单位，它由质子和中子组成，具有相同的质子数。同位素是指质子数相同但中子数不