商业合同丢失后的处理办法如下：
及时通知对方并寻求补签
联系合同另一方，说明合同丢失的情况，并请求其提供一份合同副本或重新签订一份合同。在重新签订合同时，应确保合同条款清晰，双方权益明确，并注明合同丢失的情况。
寻找其他证据
如果无法从对方处获得合同副本，可以寻找其他能够证明合同关系存在的证据，如邮件、汇款记录、聊天记录、租金支付记录、押金收据、水电费缴纳记录等。
登报遗失声明
可以选择登报遗失声明，以备日后作为证据使用。
法律途径
如果以上方法均无法解决问题，可以考虑通过法律途径解决。可以向法院提起诉讼，请求法院确认合同关系的存在，并要求对方提供相应的证据。
建立合同管理档案
为所有合同建立专门的档案夹，分门别类存放，并设定专人负责管理合同，确保随时能找到需要的文件。
电子化备份
除了原件存放，可以考虑为合同进行扫描并存储在公司的加密系统中，虽然电子备份不具备原件的法律效力，但可以作为补充参考。
联系中介或保险公司
如果是通过中介公司或保险公司签订的合同，可以联系他们，询问是否保留有合同备份，并请求他们提供一份副本。
双方一致承认并按原合同履行
如果双方均承认合同的存在，并且按照合同的约定履行，那么合同丢失本身对合同效力和履行没有影响。但为了避免后续纠纷，建议尽快采取上述措施。
通过以上措施，可以最大程度地减少合同丢失带来的风险，并确保合同关系的合法性和有效性。
