在深圳打工被扣工资可能有以下几种原因：
违法克扣工资
用人单位不得无故克扣劳动者工资。如果用人单位扣除了50%的工资，这属于违法行为。
未签订劳动合同
如果用人单位未与劳动者签订《劳动合同》，根据法律规定，用人单位应支付双倍工资。
合法代扣工资
用人单位在某些情况下可以代扣劳动者工资，例如代扣代缴的个人所得税、应由劳动者个人负担的社会保险费用、法院判决或裁定中要求的抚养费和赡养费，以及其他法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的费用。
迟到扣工资
如果劳动者因不可抗力（如地震、水灾、火灾等）导致迟到，则不应被扣工资。但如果是由于大风、大雨等天气原因迟到，则需看公司的具体规定。一般情况下，迟到扣工资需要劳动者提供证据，如交警出警记录，以证明并非故意违纪迟到。
未完成劳动定额或承包任务
如果劳动者未完成劳动定额或承包任务，用人单位可以低于最低工资标准支付工资，但双方约定的此类条款不具有法律效力。
建议劳动者在遇到工资被扣的情况时，首先应了解扣款的具体原因和依据，如果认为扣款不合法或不合理，可以向劳动监察部门举报或向法院起诉，维护自己的合法权益。
